Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Dkk3Q9QUN9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms