Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Col5a3Q9JLI2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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