Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nectin1Q9JKF6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms