Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms