Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms