Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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