Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms