Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rhox9Q9EQM5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms