Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnft1Q9DCN7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms