Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syde1Q9DBZ9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms