Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrpraQ9DBG7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms