Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrmuQ9DAT5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrmuQ9DAT5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TrmuQ9DAT5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TrmuQ9DAT5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TrmuQ9DAT5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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