Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Tmem239Q9DA47 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tmem239Q9DA47 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tmem239Q9DA47 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tmem239Q9DA47 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tmem239Q9DA47 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tmem239Q9DA47 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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