Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms