Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx5Q9D8U8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx5Q9D8U8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx5Q9D8U8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms