Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms