Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms