Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lonrf3Q9D4H7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms