Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc6Q9D4E6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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