Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc6bQ9D289 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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