Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx56Q9D0R4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx56Q9D0R4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx56Q9D0R4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx56Q9D0R4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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