Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem88Q9D0N8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms