Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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