Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CYI0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms