Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Xrcc3Q9CXE6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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