Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Dis3Q9CSH3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms