Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd5Q9CQP3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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