Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms