Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms