Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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