Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms