Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rpa3Q9CQ71 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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