Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nsmce3Q9CPR8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nsmce3Q9CPR8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nsmce3Q9CPR8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms