Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ino80bQ99PT3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ino80bQ99PT3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ino80bQ99PT3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms