Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2a1Q99PM3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms