Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cntnap4Q99P47 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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