Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms