Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms