Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nmd3Q99L48 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nmd3Q99L48 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nmd3Q99L48 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nmd3Q99L48 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nmd3Q99L48 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nmd3Q99L48 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms