Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms