Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ciao1Q99KN2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ciao1Q99KN2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ciao1Q99KN2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms