Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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