Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms