Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms