Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms