Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms