Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms