Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub2Q91WG3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms