Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usb1Q91W78 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usb1Q91W78 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usb1Q91W78 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usb1Q91W78 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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