Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd3Q91W18 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms